新型冠狀 病毒的檢測方法主要包含核酸檢測、抗體檢測、抗原檢測幾種方法。由于抗原檢測檢出率較低，目前新冠檢測主要集中在抗體和核酸檢測。核酸檢測目前是新型冠狀 病毒檢測的“金標準”，具有早期診斷、靈敏度和特異性高等特點(diǎn)；但抗體檢測操作便捷、檢測迅速，可作為核酸診斷的補充手段，但由于抗體檢測“假陽(yáng)性”和“假陰性”的局限性，不適合用于復工復產(chǎn)復學(xué)等普通人群篩查，也不適用于在低流行地區的流行病學(xué)調查。

檢測原理：

所有生物除朊病毒外都含有核酸，核酸包括脫氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA）。新型冠狀 病毒(2019-nCoV)屬于Beta冠狀 病毒屬(Betacoronavirus)，該病毒是蛋白包裹的單鏈正鏈RNA病毒，寄生和感染高等動(dòng)物（包括人）。病毒中特異性RNA序列是區分該病毒與其它病原體的標志物，新型冠狀 病毒出現后，我國科學(xué)家已經(jīng)成功發(fā)現了新型冠狀 病毒中的特異性核酸序列。如疑似患者樣本中能檢測到新型冠狀 病毒的特異性核酸序列，則認為該患者可能被新型冠狀 病毒感染。 新型冠狀 病毒常用的核酸診斷方法有兩種：病毒核酸特異基因檢測和病毒基因組測序。較常見(jiàn)的檢測新型冠狀 病毒特異性核酸序列的方法是熒光定量PCR（聚合酶鏈式反應）。由于新型冠狀 病毒是RNA病毒，試劑盒檢測基本都采用反轉錄加實(shí)時(shí)聚合酶鏈式反應法（RT-PCR），擴增病原體的核酸 (RNA) ，同時(shí)通過(guò)熒光探針實(shí)時(shí)檢測擴增產(chǎn)物。在PCR反應體系中，包含一對特異性引物以及一個(gè)Taqman探針，該探針為一段特異性寡核苷酸序列，兩端分別標記了報告熒光基團和淬滅熒光基團。探針完整時(shí)，報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收；如反應體系存在靶序列，PCR反應時(shí)探針與模板結合，DNA聚合酶沿模板利用酶的外切酶活性將探針酶切降解，報告基團與淬滅基團分離，發(fā)出熒光。每擴增一條DNA鏈，就有一個(gè)熒光分子產(chǎn)生。熒光定量PCR儀能夠監測出熒光到達預先設定閾值的循環(huán)數（Ct值）與病毒核酸濃度有關(guān)，病毒核酸濃度越高，Ct值越小。不同生產(chǎn)企業(yè)的產(chǎn)品會(huì )依據自身產(chǎn)品的性能確定本產(chǎn)品的陽(yáng)性判斷值。

由于每個(gè)RT-PCR反應需要2個(gè)小時(shí)左右才出結果，因此，試劑盒在開(kāi)發(fā)時(shí)一般都針對病毒序列中高度保守的2-3個(gè)序列比如編碼replicase（復制酶）或者necleocapsid（核蛋白衣，核鞘）的核酸序列設計引物，但是各個(gè)方法用的序列都不完全相同。一些方法使用multiplex，也就是把多個(gè)目標序列在同一反應管中擴增；另一些采用分步，先用一個(gè)目標序列篩查，陽(yáng)性后再用另一個(gè)序列確認，這樣可以有效縮短整個(gè)流程時(shí)間，加快檢測速度。另外RNA病毒變異很快，用多個(gè)保守目標序列可以防止病毒變異造成的假陰性。

目前批準產(chǎn)品均基于新型冠狀 病毒基因組中開(kāi)放讀碼框1a/b（open reading frame 1ab，ORF1ab）、包膜蛋白（Envelope protein，E）和核衣殼蛋白（nucleocapsid protein，N）進(jìn)行選擇。不同產(chǎn)品的檢測原理基本一致，但是其引物、探針設計存在不同，有單靶區段（ORF1ab）、雙靶區段（ORF1ab、N蛋白）、三靶區段（ORF1ab、N蛋白和E蛋白）的檢測和判讀差別。一般檢測位于病毒ORF1ab和N基因上的兩個(gè)靶標，同一份標本需滿(mǎn)足雙靶標陽(yáng)性或重復檢測為單靶標陽(yáng)性或兩種標本同時(shí)滿(mǎn)足單靶標才能確認SARS-CoV-2病毒核酸陽(yáng)性。

檢測流程：

檢測程序需要經(jīng)過(guò)五個(gè)步驟，取樣、留樣、保存、核酸提取、上機檢測。首先根據試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行樣本采集，樣本類(lèi)型包括咽拭子、鼻拭子、痰液、支氣管灌洗液、肺泡灌洗液等。由于RNA易降解，因此，采集樣本時(shí)使用無(wú)RNA酶的拭子和無(wú)RNA酶的儲存管。獲得患者樣本后，需盡快進(jìn)行檢測，如無(wú)法立即檢測需要進(jìn)行低溫封裝，并送到專(zhuān)門(mén)的檢測機構進(jìn)行檢測。檢測機構收到樣本后，對樣本進(jìn)行核酸提取，核酸提取試劑應使用批準產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)中指定的核酸提取試劑盒。zui后是熒光PCR核酸檢測，也就是上機器檢測，將提取物進(jìn)行熒光PCR擴增反應，需要70—80分鐘。